Віталій Шабунін мобілізувався у перші дні повномасштабного воргнення – у лютому 2022 року.  Попри це – ДБР інкримінує Шабуніну «ухилення від військової служби» та «шахрайство».   Підозра стосується періоду, коли Шабунін був офіційно відряджений до Національного агентства з питань запобігання корупції (НАЗК) за наказом командування, який він не міг не виконувати.   Сам факт виконання наказу не може бути кваліфікований як ухилення від служби — це пряме протиріччя здоровому глузду та військовому праву.   Водночас в Україні сотні військових, яких на первний час відкомандировують для служби у цивільних установах. У тому ж самому НАЗК у період, коли туди був відкомандирований Шабунін, в такому ж статусі перебувало ще кілька військових. Проте підозру від ДБР – отримав тільки Шабунін. Обвинувачення в «шахрайстві» базуються на стандартних військових виплатах, які він отримував під час законної відсутності у підрозділі — жодних «бойових» виплат чи привласнення коштів не відбувалося.  Сума, якою, на думку ДБР, незаконно заволодів Шабунін, завдавши "матеріальної шкоди державному бюджету в особі військової частини" – 224 249,49 грн, з яких. 183 811,06 грн – це грошове забезпечення військовослужбовця, а 40 438,43 грн – це сплачене ЄСВ.  Заяви слідства про заволодіння коштами ґрунтуються на маніпулятивних трактуваннях норм, які не враховують реальної служби та наказів командування.   По суті йдеться про безпідставну кваліфікацію виплат як «шахрайства», хоча йдеться про стандартне грошове забезпечення, передбачене законом. Також ДБР збрехало у своєму прес-релізі щодо справи Шабуніна, зазначивши,(https://dbr.gov.ua/news/dbr-povidomilo-pro-pidozru-odnomu-iz-gromadskih-aktivistiv-za-uhilennya-vid-vijskovoi-sluzhbi-ta-shahrajstvo) що він начебто “незаконно використовував позашляховик, ввезений в Україну як гуманітарна допомога для потреб армії”. Натомість Шабунін показав сам автомобіль (https://www.radiosvoboda.org/a/news-shabunin-pidozra-avto-poyasnennya/33476682.html)та документи на нього – акт передачі й техпаспорт, де зазначено, що машина передається в користування йому як конкретному військовослужбовцю для виконання бойових завдань.  Донори авто (зокрема представники бізнес‑клубу CEO Club) публічно підтвердили, що купили позашляховик саме під нього як військового і передали йому законно, як службовий транспорт для фронту.  За поясненнями Шабуніна, машина використовувалася для поїздок у підрозділ на схід, певний час була в Києві під час очікування нового розпорядження, а потім поїхала з ним на інше місце служби, тобто залишалася в контексті військових задач. <iframe width="560" height="315" src="https://www.youtube.com/embed/IX9sc0_KEJM?si=6pvzfoBZDwjCayDz" title="YouTube video player" frameborder="0" allow="accelerometer; autoplay; clipboard-write; encrypted-media; gyroscope; picture-in-picture; web-share" referrerpolicy="strict-origin-when-cross-origin" allowfullscreen></iframe>

Справа проти Шабуніна – частина ширшої кампанії Банкової для залякування антикорупційних активістів у момент, коли влада проштовхувала підпорядкування НАБУ та САП Генпрокурору. Ось як відбувалися події:  • 11 липня 2025 року ДБР провело обшуки у Віталія Шабуніна та оголосило йому підозру в ухиленні від служби та шахрайстві. • 22 липня 2025 року Верховна Рада проголосувала за законопроєкт №12414, який підпорядкував НАБУ і САП Генеральному прокурору та фактично знищив їхню процесуальну незалежність. Закон набув чинності 23 липня 2025 року, викликавши різку критику громадськості та міжнародних партнерів. • 31 липня Верховна Рада ухвалила закон, який скасував попередні зміни та відновив інституційну й процесуальну незалежність НАБУ і САП від Генпрокурора та інших органів державної влади.

Шабунін – один із головних публічних критиків влади та українських активістів, які регулярно спілкуються з міжнародними партнерами України та ключовими медіа світу.  Він є одним із найвидиміших лідерів антикорупційного руху, який роками критикував Офіс президента, уряд, Міноборони, НАБУ, САП, тобто справу легко зчитують як помсту за системну критику, а не як нейтральне розслідування. Правозахисні та антикорупційні організації прямо говорять,(https://www.pravda.com.ua/news/2025/07/15/7521805/) що використання силовиків для переслідування такого рівня активіста створює «охолоджувальний ефект»: інші громадські діячі бачать ризик, що за публічні розслідування й кампанії проти корупції можуть отримати обшуки, підозри й зламане життя. У заявах громадських організацій підкреслено: “Це переслідування є черговим епізодом у багаторічній історії атак на Віталія Шабуніна особисто та на очолюваний ним Центр протидії корупції, які тривають починаючи з 2016 року”.